- 中央館2F:開架 (31)
- 中央館:図書書庫3層 (27)
- 医学分館2F:図書 (26)
- 医学分館書庫:2層(図書) (26)
- 中央館:閉架書庫1(図書) (20)
- 保健学科図書室 (15)
- 中央館:図書書庫2層 (5)
- 経済分館(2F開架) (5)
- 中央館2F:大型資料 (3)
- 中央館2F:NHKブックス (3)
- 中央館:図書書庫3層(文庫・新書) (3)
- 中央館:図書書庫4層(NHKブックス) (3)
- 中央館2F:岩波新書 (2)
- 中央館2F:新書 (2)
- 中央館:閉架書庫1(大型) (2)
- 環境科学部 (2)
- 原資料調査室(原研情報室) (2)
- 熱国際保健 (2)
- 原幹細胞生物学(原研幹細胞) (1)
- 中央館2F:古本募金 (1)
- 中央館:閉架書庫1(旧師範) (1)
- 中央館:図書書庫1層(大型資料) (1)
- ゲノム機能解析分野 (1)
- 経済分館(別置S棟) (1)
- 経済分館(新着図書) (1)
- 教育学部 (1)
- 医学分館1F:図書 (1)
- 医学分館1F:グビロが丘文庫1 (1)
- 医学分館1F:グビロが丘文庫2 (1)
- 医学臨床検査医学 (1)
- 医学精神神経学 (1)
- 熱生態疫学 (1)
- 薬学部 (1)
- 先端創薬イノベーションセンター創薬支援室 (1)