- 経済分館書庫 (430)
- 医学分館書庫:2層(図書) (430)
- 中央館:閉架書庫1(図書) (123)
- 中央館:図書書庫3層 (92)
- 経済分館(別置S棟) (82)
- 中央館:図書書庫2層 (77)
- 中央館:図書書庫4層 (70)
- 中央館3F:参考 (56)
- 経済分館(2F開架) (53)
- 中央館:図書書庫5層 (52)
- 中央館2F:開架 (39)
- 中央館:図書書庫1層 (26)
- 経済分館(別置Z棟-3:統計白書) (18)
- 教育学部 (17)
- 工学部 (16)
- 水産学部 (15)
- 医学分館2F:図書 (15)
- 環境科学部 (13)
- 言語教育研究センター (11)
- 経済学部 (10)
- 医学分館2F:郷土 (10)
- 熱帯医学・グローバルヘルス研究科 (10)
- 中央館3F:郷土 (7)
- 原資料調査室(原研情報室) (7)
- 中央館:図書書庫4層(NHKブックス) (6)
- 経済分館参考 (6)
- 経済分館書庫2層:初期学部和図書 (6)
- 中央館2F:本学関係 (5)
- ICT基盤センター (5)
- 経済分館(集密書庫) (5)
- 経済東南アジア研究所(東南アジア文庫) (5)
- 中央館事務部 (4)
- 中央館:図書書庫3層(文庫・新書) (4)
- 多文化社会学部 (4)
- 医学分館1F:グビロが丘文庫2 (4)
- 医学分館2F:参考 (4)
- 中央館3F:平和 (3)
- 中央館:閉架書庫1(大型) (3)
- 経済分館(郷土) (3)
- 経済分館書庫2層:高商和図書 (3)
- 経済分館書庫3層:初期学部洋図書 (3)
- 工学部情報システム工学科 (3)
- 医学良順会館 (3)
- 薬学部 (3)
- 中央館2F:多文化 (2)
- 中央館2F:古写真資料室 (2)
- 中央館:閉架書庫1(日蘭文庫) (2)
- 中央館:閉架書庫1(参考) (2)
- 中央館:閉架書庫1(旧師範) (2)
- 中央館:閉架書庫2(図書) (2)
- 生涯教育センター(教育開発推進機構) (2)
- 経済分館(事務) (2)
- 保健学科図書室 (2)
- 医学解剖二(肉眼解剖学) (2)
- バイオメディカルモデル動物研究センター (2)
- 中央館2F:BS (1)
- 中央館2F:文庫 (1)
- 中央館2F:岩波文庫 (1)
- 中央館2F:大型資料 (1)
- 中央館2F:新書 (1)
- 中央館:閉架書庫1(蔵書目録) (1)
- 中央館:図書書庫1層(特大) (1)
- 留学生教育・支援センター (1)
- 歯学補綴二(歯科補綴学) (1)
- 経済分館書庫3層:高商洋図書 (1)
- 経済東南アジア研究所(東亜文庫) (1)
- 工学部社会開発工学科 (1)
- 医学分館1F:グビロが丘文庫1 (1)
- 医学分館1F:ひとやすみ文庫 (1)
- 医学分館貴重資料 (1)
- 医学分館書庫:1層(和雑誌) (1)
- 熱病害動物学 (1)
- 熱ミュージアム (1)
- 中央館調査中 (1)
- 旧部局 (1)